制药纯化水设备和管道系统广泛使用不锈钢，不锈钢有不反应性、耐腐蚀的特点，能满足生产和热消毒的要求。然而，热塑性材料可提供改进的质量或低的成本。便宜一点的塑胶，如聚丙烯(PP)和聚氯乙烯(PVC)可以在非制药纯化水设备中使用。其他的，比如聚偏氟乙烯(PVDF)提供更强的抗热能力，可适合应用于制药用水。如果考虑不锈钢系统包括钝化、内窥镜检测、X射线检测在内等因素，PVDF系统的成本可比不锈钢系统的成本大约低 10～15%。连接PVDF管道的新方法比不锈钢焊接的更加平滑。然而，在高温下塑性材料的热膨胀成为主要问题。
如果计划进行常规的钝化，材料的选择应在整个分配、储存和工艺系统中保持*(都是316L不锈钢或者是304L不锈钢等)。对于药典规定用水系统，选的材料是316L不锈钢。不锈钢管道的保温应当不能含有氯化物，支架要有隔离装置来防止电流腐蚀。
304L不锈钢和316L不锈钢已经成为行业中作为制药用水储罐材质的之选，为了避免焊接热影响区的铬损耗，与壳体接触的夹套材质应是兼容的。非药典规定用水的储存可能不需要相同的抗腐蚀水平或使用低碳镍铬合金并做特殊的表面处理，这取决于用户对水的要求。
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